A ferramenta ajuda os cientistas na fonte de doença neurológica com estatística e ciência de dados

Pesquisadores da Universidade de Carnegie Melon desenvolveram um equipamento estatístico que pode ajudar a indicar mudanças genéticas que causam doenças como Alzheimer e esquizofrenia. Enquanto os cientistas identificam há muito tempo os genes associados a essas condições, confirmando que a doença permanece um desafio devido à doença. O equipamento, CausArray, fornece esperança.

Catherine Rowder, da CMU, professora de estatísticas e ciências da vida na Universidade da UPMC, nos departamentos de estatística e ciência de dados e biologia de computadores, disse que o motivo já se mostrou eficaz na identificação de importantes mudanças genéticas.

Ele disse: “Proceder a partir do estudo estatístico da associação é uma das principais realizações da região nos últimos 10 anos”, afirmou.

Raider estudou com Jin-Hong Du e Maya Shane da CMU, bem como Hansudi Mathis, professora assistente do Departamento de Neurobiologia da Universidade de Pittsburgh.

Elevação

CausArray depende do conceito de “confuder sem fôlego” -Sul, muitas vezes fatores ocultos que falam o destino de uma célula. “Você tem uma vida separada. Nós confudimos”, disse Rowder. “Ok, as células também têm confusão.”

Como exemplo de como o CausArray pode ser usado, Roeder disse que este dispositivo será necessário na análise do CRISPR (que regularmente significa clusters para clusters para clusters de aglomerados para pequenas repetições palyindrômicas). Em um estudo específico do CRISPR, os pesquisadores podem selecionar o DNA de um organismo vivo, retirando um gene em uma célula e depois pode ver o que acontece, comparando os resultados para comparar a posição das células, que foi deixada intocada.

No entanto, essas abordagens não podem ser levadas em consideração Ciclo celular Ou temperatura do experimento – que pode afetar cada célula que também pode afetar o caminho, independentemente de qual Jean Foi nocauteado.

“O que dizemos, bem, vamos pegar esta célula que recebeu o tratamento e adivinhe o que aconteceu com essa célula em particular, se não for tratada”, disse Rowder. “Isso é o que é conhecido como oposição.”

Ao mesmo tempo, o causarray usa grandes quantidades de dados de expressão gênica para prever quais serão as células de controle.

Escritor principal e Ph.D. Em programas de estatística e aprendizado de máquina. “E corrigindo esses efeitos, estamos tentando ir da associação ao motivo”.

Para ficar claro, Rowder e Du disseram que não inventaram retaliação. Em vez disso, eles estão entre as primeiras pessoas a aplicá -lo em genômica, usando o software CausArray de maneira elegante codificada por DU.

“Você pode realmente ver as características dos dados, e os dados aumentarão esse sinal devido a uma correlação subjacente no gene”, disse o Rowder. “Avanços recentes, como o CRISPR, prometem liderar sucessos reais em nossa compreensão dos distúrbios do cérebro, mas alcançaremos apenas esses avanços se estiverem conectados com poderosos equipamentos estatísticos.

“Esta é a sua mágica.”

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